Identyfikacja protetycznych patogenów chorób za pomocą metody metagenomicznej

width=300Metagenomiczne sekwencjonowanie może zmienić liczbę infekcji, szczególnie tych spowodowanych przez trudne do hodowli organizmy. Metagenomics został wykorzystany do zbadania protekcyjnych infekcji stawów (PJI), gdzie wykrywanie patogenu może być wyzwaniem.

Metody

Zbadano czterysta osiem próbek płynu ultradźwiękowego wytworzonych z resekcji stawu biodrowego i kolanowego, w tym 213 od osób z infekcjami i 195 od osobników bez zakażenia. Próbki wzbogacono w DNA drobnoustrojów stosując podstawowy zestaw MolYsis, amplifikowano cały genom i zsekwencjonowano za pomocą instrumentów Illumina HiSeq 2500. Zaprojektowano rurociąg, aby odfiltrować ludzkie odczyty i przeanalizować pozostałe sekwencje pod kątem zawartości drobnoustrojów przy użyciu narzędzi Livermore Metagenomics Analysis Toolkit i MetaPhlAn2.

Wyniki

W porównaniu z hodowlą płynów ultradźwiękowych biolodzy byli w stanie zidentyfikować znane patogeny w 94,8% (109/115) PJI dodatnich od hodowli, a dodatkowe potencjalne patogeny wykryto w 9,6% (11/115). Nowe potencjalne patogeny wykryto w 43,9% (43/98) kulturowych negatywnych PJI, z których 21 nie miało innych pozytywnych źródeł kultury, z których wykryto te mikroorganizmy. Wykrywanie drobnoustrojów w próbkach z niezakażonych aseptycznych niepowodzeń było odwrotnie (7/195 [3,6%] przypadków). Obecność ludzkiego i zanieczyszczającego DNA drobnoustrojów z odczynników była wyzwaniem, jak wcześniej podano.

Wnioski

Metagenomiczne sekwencjonowanie jest potężnym narzędziem do identyfikacji szerokiej gamy patogenów PJI, w tym trudnych do wykrycia patogenów w infekcjach ujemnych w hodowli.
[hasła pokrewne: szpital orzepowice, erozja rogówki, rodzaje ściegów ]

Wentylacja oscylacyjna o wysokiej częstotliwości w porównaniu do konwencjonalnej wentylacji mechanicznej dla niemowląt o bardzo niskim urodzeniu

Skuteczność i bezpieczeństwo wczesnej wentylacji oscylacyjnej o wysokiej częstotliwości w porównaniu z konwencjonalną synchronizowaną przerywaną obowiązkową wentylacją w leczeniu niemowląt o bardzo niskiej masie urodzeniowej nie zostały ustalone. Metody
Przeprowadziliśmy randomizowane, wieloośrodkowe badanie kliniczne, aby ustalić, czy niemowlęta leczone wentylacją oscylacyjną o wysokiej częstotliwości były bardziej prawdopodobne niż niemowlęta, którym podawano zsynchronizowaną przerywaną wentylację wymuszoną, bez konieczności stosowania uzupełniającego tlenu w wieku 36 tygodni w okresie pomenstrualnym. Kwalifikujące się niemowlęta ważyły od 601 do 1200 g przy narodzinach, były w wieku poniżej czterech godzin, otrzymały jedną dawkę środka powierzchniowo czynnego i wymagały wentylacji ze średnim ciśnieniem w drogach oddechowych wynoszącym co najmniej 6 cm wody i ułamkiem zainspirowanego tlenu co najmniej 0,25 . Niemowlęta stratyfikowano według masy urodzeniowej i ekspozycji na kortykosteroidy w okresie prenatalnym, a następnie losowo przydzielano do wentylacji oscylacyjnej o wysokiej częstotliwości lub zsynchronizowanej przerywanej wentylacji wymuszonej. Wentylację prowadzono zgodnie z protokołami opracowanymi w celu optymalizacji inflacji płuc i wartości ciśnienia krwi. Read more „Wentylacja oscylacyjna o wysokiej częstotliwości w porównaniu do konwencjonalnej wentylacji mechanicznej dla niemowląt o bardzo niskim urodzeniu”

Wentylacja oscylacyjna o wysokiej częstotliwości w porównaniu do konwencjonalnej wentylacji mechanicznej dla niemowląt o bardzo niskim urodzeniu ad 8

Wykazano, że rekrutacja płuca jest ważna dla uzyskania optymalnego wyniku z wentylacją oscylacyjną o wysokiej częstotliwości. 4, 7, 36, 38, 40, 41, 4. Zważywszy, że FiO2 był nieco wyższy u niemowląt przypisanych do wentylacji oscylacyjnej o wysokiej częstotliwości podczas w pierwszym tygodniu możliwe było, że można było jeszcze lepiej rekrutować.53 Niemniej jednak stwierdziliśmy, że wentylacja oscylacyjna o wysokiej częstotliwości stosowana w tej strategii znacząco poprawiła rokowanie oddechowe w tej populacji. Chociaż badanie HIFI sugerowało, że wentylacja oscylacyjna o wysokiej częstotliwości zwiększa częstość występowania krwotoku śródczaszkowego i torbielowatej perystrogramowej leukomalacji, 20 innych badań dało sprzeczne wyniki.17,19,21,23 W naszym dużym badaniu nie stwierdzono różnicy w częstości występowania krwawienia wewnątrzczaszkowego lub torbielowata okołopokwitaniowa leukomalacja, ustalenia zgodne z wynikami poprzedniej metaanalizy. 53 Częstość występowania ciężkiego krwotoku śródczaszkowego w naszym badaniu była podobna do obserwowanej w innych badaniach.54,55 Częstość występowania torbielowatej perystecularnej leukomalacji u niemowląt przypisanych do wentylacja oscylacyjna o wysokiej częstotliwości i te, które są przeznaczone do zsynchronizowanej przerywanej wentylacji wymuszonej, były wyższe niż niektóre opublikowane wskaźniki, prawdopodobnie dlatego, że można pominąć torbielowatą okołokomorową, jeśli ultrasonografia czaszki nie zostanie wykonana od sześciu do ośmiu tygodni po urodzeniu.57-59 Połowa przypadków wykryto torbielowatą guzkowatoczoczkową leukomalację u naszych pacjentów w czasie trzeciego badania ultrasonograficznego czaszki. Read more „Wentylacja oscylacyjna o wysokiej częstotliwości w porównaniu do konwencjonalnej wentylacji mechanicznej dla niemowląt o bardzo niskim urodzeniu ad 8”

Ostra babesioza spowodowana przez Babesia divergens u rezydenta stanu Kentucky

Babesia divergens jest główną przyczyną ludzkiej babeszjozy w Europie, powodując śmiertelność na poziomie 42 procent wśród osób, które przeszły splenektomię i 5 procent wśród osób z nietkniętymi śledzionami.1 Znany tytoń wektorowy, Ixodes ricinus, 2 nie jest rodzimy dla Ameryki Północnej . Zgłaszamy, co uważamy za pierwszy ludzki przypadek babeszjozy wywołanej przez B. divergens w Ameryce Północnej.
Ryc. 1. Read more „Ostra babesioza spowodowana przez Babesia divergens u rezydenta stanu Kentucky”

Odlewanie oskrzeli

Obraz w medycynie klinicznej zatytułowany Obrzęk oskrzeli (wydanie z 28 marca) opisuje pacjenta, który miał objawy oddechowe przez sześć miesięcy i który wykrztuszał obsadę oskrzelową. Jednak autorzy nie wspominają o wyniku. Czy pacjent został wyleczony po odkrztuszeniu tej dość dużej obsady. Większość lekarzy nadal jest zainteresowana odpowiedziami na takie pytania.
Douglas R. Read more „Odlewanie oskrzeli”

grudziądz szpital ul rydygiera cd

Zdarzenia brane pod uwagę przy ocenie czasu przeżycia wolnego od nawrotów były pierwszą miejscową, regionalną lub odległą nawrotem lub zdarzeniem w piersiach drugiej strony, która została uznana za nawrót. Odległe nawroty, które wystąpiły albo jako pierwszy nawrót, albo po nawrocie lokalnym lub regionalnym, przeciwległe raki sutka i inne wtórne nowotwory zostały uwzględnione w ocenie przeżycia wolnego od choroby odległej. Wszystkie zgony zostały uwzględnione w obliczeniu ogólnego czasu przeżycia. Metoda Kaplana-Meiera została zastosowana do oszacowania krzywych dla przeżycia wolnego od choroby, przeżycia wolnego od choroby odległej, przeżycia wolnego od nawrotów i całkowitego przeżycia dla każdej grupy leczenia.9 Szacunki są dostarczane z ich standardowymi błędami. Porównania metod leczenia przeprowadzono za pomocą testów logarytmicznych dostępnych danych dla wszystkich czasów obserwacji10. Read more „grudziądz szpital ul rydygiera cd”

Porównanie stentowania z minimalnie inwazyjną pomostem typu Bypass dla zwężenia lewej tętnicy wieńcowej zstępującej ad

Uszkodzenie musiało być ograniczone do odcinka między początkiem lewej tętnicy wieńcowej okalającej a pierwszą główną gałęzią przegrodową. Pacjenci byli wykluczani, jeśli mieli ostre zespoły wieńcowe wymagające natychmiastowej interwencji, dodatkowe istotne klinicznie uszkodzenia wieńcowe lub wady zastawkowe wymagające leczenia lub zwężenie pierwszej gałęzi po przekątnej lub zwężenie rozciągające się na dużej przekątnej gałęzi lub jeśli poprzednio poddano je zabiegom interwencyjnym lub chirurgicznym na chorobę wieńcową. Wykluczono również pacjentów z całkowitą niedrożnością i pacjentów z tętniczym dośrodkiem lewej tętnicy zstępującej, ponieważ minimalnie inwazyjna operacja wymaga pełnej wizualizacji docelowego naczynia. Kardiochirurg i kardiolog musieli uzgodnić kwalifikację każdego pacjenta przed randomizacją. Badanie zostało zatwierdzone przez lokalny komitet etyczny. Read more „Porównanie stentowania z minimalnie inwazyjną pomostem typu Bypass dla zwężenia lewej tętnicy wieńcowej zstępującej ad”

Doświadczenia pielęgniarek z Oregonu i pracowników socjalnych z pacjentami hospicyjnymi, którzy poprosili o pomoc w samobójstwie ad

Każdy respondent dostarczył informacje jedynie o ostatnim pacjenta, który złożył wyraźną prośbę o wydanie śmiercionośnej recepty od listopada 1997 r., A następnie zmarł. Respondenci ocenili znaczenie 21 możliwych powodów, dla których pacjent złożył wniosek, w skali od (wcale nie ważne) do 5 (bardzo ważne). Oznaczono osobne pudełko, jeśli nie wiedzieli, czy przyczyna była ważna, czy też nie rozmawialiśmy o tym z pacjentem lub członkiem rodziny. Respondenci zostali poproszeni o porównanie cech pacjenta, który poprosił o pomoc z samobójcą i jego lub jej rodziny opiekunów, z cechami innych pacjentów hospicyjnych i ich opiekunów rodzinnych w skali od (znacznie mniej niż inni hospicjanci lub członkowie rodziny) do 5 (znacznie więcej niż inni hospicjanci lub członkowie rodziny). W 10-punktowej skali respondenci ocenili całkowity spokój pacjenta (0 oznaczało bardzo spokojne i 9 wcale nie było spokoju), cierpienie (0 oznacza brak i 9 ciężkie, nieustające cierpienie) oraz ból (z 0 oznaczeniem brak i 9 ciężki, niestrudzony ból) na dwa tygodnie przed śmiercią i jakość procesu umierania (z 0 oznaczającym bardzo źle i 9 bardzo dobrze). Read more „Doświadczenia pielęgniarek z Oregonu i pracowników socjalnych z pacjentami hospicyjnymi, którzy poprosili o pomoc w samobójstwie ad”

Rak mózgu

Ta książka, kompendium aktualnych koncepcji w neuro-onkologii, jest częścią serii American Cancer Society of Clinical Oncology. Składa się z 23 jasno zaprezentowanych i dobrze zilustrowanych rozdziałów napisanych przez 42 autorów, wielu z Uniwersytetu Kalifornijskiego w San Francisco. Rozdziały można ogólnie podzielić na demografię guzów mózgu (epidemiologia, histopatologia, zespoły rodzinne i genetyczne), obrazowanie (obrazowanie metodą rezonansu magnetycznego i skanowanie pozytronowe) oraz aktualne metody leczenia (chirurgia, chemioterapia i napromienianie). Książka zawiera również rozdziały poświęcone szczególnym okolicznościom nowotworów wieku dziecięcego, oponiakom, guzom kręgosłupa, przerzutom i zespołom paraneoplastycznym. Mocne strony książki są kilka. Read more „Rak mózgu”

Bradykinin-Mediated Angioedema

Obrzęk naczynioruchowy to niestały, blady obrzęk tkanki podskórnej lub podśluzówkowej, który ma tendencję do nawracania się przewlekle i może zagrażać życiu, jeśli obrzęk wystąpi w górnych drogach oddechowych lub może być bardzo bolesny, jeśli wystąpi w przewodzie żołądkowo-jelitowym. Obrzęk naczynioruchowy wraz z pokrzywką1 zwykle dobrze reaguje na leki przeciwhistaminowe i kortykosteroidy, podczas gdy obrzęk naczynioruchowy bez pokrzywki często jest oporny na taką terapię, ale może reagować na inhibitor C1-esterazy, kwas traneksamowy lub obie te terapie, które mogą zmniejszać wytwarzanie bradykininy. Te odkrycia podnoszą kwestię, czy bradykinina pośredniczy w obrzęku naczynioruchowym.
Rysunek 1. Rycina 1. Read more „Bradykinin-Mediated Angioedema”